В составе института 11 кафедр:

• Кафедра 301 «Системы автоматического и интеллектуального управления»
• Кафедра 304 «Вычислительные машины, системы и сети»
• Кафедра 305 «Пилотажно-навигационные и информационно-измерительные комплексы»
• Кафедра 307 «Цифровые технологии и информационные системы»
• Кафедра 309 «Теоретическая электротехника»
• Кафедра 310 «Электроэнергетические, электромеханические и биотехнические системы»
• Кафедра 311 «Прикладные программные средства и математические методы»
• Кафедра 315 «Управление высокотехнологичными предприятиями»
• Кафедра 316 «Системное моделирование и автоматизированное проектирование»
• Кафедра 317 «Управление инновациями»
• Кафедра 319 «Системы интеллектуального мониторинга»